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NDB ID: 7JRT  PDB ID: 7JRT 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (112)Relative Frequency
cWW1110.991
cWH10.009
Base-PhosphateCount (240)Relative Frequency
8BPh30.013
9BPh10.004
0BPh2360.983
Base-StackingCount (169)Relative Frequency
s3310.006
s53890.527
s55790.467

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)