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NDB ID: 7OA3  PDB ID: 7OA3 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (47)Relative Frequency
cWW280.596
cWH160.340
tHS10.021
tSS20.043
Base-PhosphateCount (82)Relative Frequency
4BPh20.024
9BPh20.024
0BPh780.951
Base-StackingCount (71)Relative Frequency
s33180.254
s53240.338
s55290.408

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)