A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 12-Aug-2022 number of released structures: 12231
Search for released structures

NDB ID: 7VNV  PDB ID: 7VNV 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7VNV|1|A|A|147VNV|1|A|A|21ncWS
7VNV|1|A|A|147VNV|1|A|G|22s55
7VNV|1|A|A|217VNV|1|A|A|14ncSW
7VNV|1|A|A|217VNV|1|A|A|210BPh
7VNV|1|A|A|217VNV|1|A|G|46s33
7VNV|1|A|A|247VNV|1|A|A|240BPh
7VNV|1|A|A|247VNV|1|A|C|12ns55
7VNV|1|A|A|247VNV|1|A|C|25s35
7VNV|1|A|A|247VNV|1|A|G|23s53
7VNV|1|A|A|247VNV|1|A|U|11cWW
7VNV|1|A|A|357VNV|1|A|A|350BPh
7VNV|1|A|A|357VNV|1|A|C|36s35
7VNV|1|A|A|357VNV|1|A|U|33
7VNV|1|A|A|377VNV|1|A|A|37n0BP
7VNV|1|A|A|377VNV|1|A|A|38s35
7VNV|1|A|A|377VNV|1|A|C|36s53
7VNV|1|A|A|387VNV|1|A|A|37s53
7VNV|1|A|A|387VNV|1|A|A|38n0BP
7VNV|1|A|A|387VNV|1|A|G|39s35
7VNV|1|A|A|447VNV|1|A|A|440BPh
7VNV|1|A|A|447VNV|1|A|G|43s53
7VNV|1|A|A|447VNV|1|A|G|45s35
7VNV|1|A|A|647VNV|1|A|A|640BPh
7VNV|1|A|A|647VNV|1|A|C|63s53
7VNV|1|A|A|647VNV|1|A|G|51s55
7VNV|1|A|A|647VNV|1|A|G|65s35
7VNV|1|A|A|647VNV|1|A|U|50cWW
7VNV|1|A|A|737VNV|1|A|A|730BPh
7VNV|1|A|A|737VNV|1|A|C|72s53
7VNV|1|A|A|737VNV|1|A|C|74s35
7VNV|1|A|A|737VNV|1|A|G|1s55
7VNV|1|A|A|767VNV|1|A|A|760BPh
7VNV|1|A|A|767VNV|1|A|C|75s53
7VNV|1|A|C|127VNV|1|A|A|24ns55
7VNV|1|A|C|127VNV|1|A|C|120BPh
7VNV|1|A|C|127VNV|1|A|G|23cWW
7VNV|1|A|C|127VNV|1|A|U|11s53
7VNV|1|A|C|167VNV|1|A|C|160BPh
7VNV|1|A|C|167VNV|1|A|G|59ntSS
7VNV|1|A|C|167VNV|1|A|G|76BPh
7VNV|1|A|C|257VNV|1|A|A|24s53
7VNV|1|A|C|257VNV|1|A|C|250BPh
7VNV|1|A|C|277VNV|1|A|C|270BPh
7VNV|1|A|C|277VNV|1|A|C|28s35
7VNV|1|A|C|277VNV|1|A|G|43cWW
7VNV|1|A|C|287VNV|1|A|C|27s53
7VNV|1|A|C|287VNV|1|A|C|280BPh
7VNV|1|A|C|287VNV|1|A|G|29s35
7VNV|1|A|C|287VNV|1|A|G|42cWW
7VNV|1|A|C|287VNV|1|A|G|43s55
7VNV|1|A|C|307VNV|1|A|C|300BPh
7VNV|1|A|C|307VNV|1|A|C|31s35
7VNV|1|A|C|307VNV|1|A|G|29s53
7VNV|1|A|C|307VNV|1|A|G|40cWW
7VNV|1|A|C|317VNV|1|A|C|30s53
7VNV|1|A|C|317VNV|1|A|C|310BPh
7VNV|1|A|C|317VNV|1|A|G|39cWW
7VNV|1|A|C|317VNV|1|A|G|40s55
7VNV|1|A|C|367VNV|1|A|A|35s53
7VNV|1|A|C|367VNV|1|A|A|37s35
7VNV|1|A|C|367VNV|1|A|C|360BPh
7VNV|1|A|C|367VNV|1|A|U|33ntHS
7VNV|1|A|C|47VNV|1|A|C|40BPh
7VNV|1|A|C|47VNV|1|A|C|5s35
7VNV|1|A|C|47VNV|1|A|G|3s53
7VNV|1|A|C|47VNV|1|A|G|69cWW
7VNV|1|A|C|417VNV|1|A|C|410BPh
7VNV|1|A|C|417VNV|1|A|G|29cWW
7VNV|1|A|C|417VNV|1|A|G|40s53
7VNV|1|A|C|417VNV|1|A|G|42s35
7VNV|1|A|C|57VNV|1|A|C|4s53
7VNV|1|A|C|57VNV|1|A|C|50BPh
7VNV|1|A|C|57VNV|1|A|G|68cWW
7VNV|1|A|C|57VNV|1|A|G|69s55
7VNV|1|A|C|617VNV|1|A|C|610BPh
7VNV|1|A|C|617VNV|1|A|C|62s35
7VNV|1|A|C|617VNV|1|A|G|53cWW
7VNV|1|A|C|617VNV|1|A|U|608BPh
7VNV|1|A|C|627VNV|1|A|C|61s53
7VNV|1|A|C|627VNV|1|A|C|620BPh
7VNV|1|A|C|627VNV|1|A|C|63s35
7VNV|1|A|C|627VNV|1|A|G|52cWW
7VNV|1|A|C|627VNV|1|A|G|53s55
7VNV|1|A|C|637VNV|1|A|A|64s35
7VNV|1|A|C|637VNV|1|A|C|62s53
7VNV|1|A|C|637VNV|1|A|C|630BPh
7VNV|1|A|C|637VNV|1|A|G|51cWW
7VNV|1|A|C|637VNV|1|A|G|52s55
7VNV|1|A|C|667VNV|1|A|C|660BPh
7VNV|1|A|C|667VNV|1|A|G|65s53
7VNV|1|A|C|667VNV|1|A|G|67s35
7VNV|1|A|C|667VNV|1|A|G|7cWW
7VNV|1|A|C|707VNV|1|A|C|700BPh
7VNV|1|A|C|707VNV|1|A|C|71s35
7VNV|1|A|C|707VNV|1|A|G|3cWW
7VNV|1|A|C|707VNV|1|A|G|69s53
7VNV|1|A|C|717VNV|1|A|C|70s53
7VNV|1|A|C|717VNV|1|A|C|710BPh
7VNV|1|A|C|717VNV|1|A|C|72s35
7VNV|1|A|C|717VNV|1|A|G|2cWW
7VNV|1|A|C|717VNV|1|A|G|3s55
7VNV|1|A|C|727VNV|1|A|A|73s35
7VNV|1|A|C|727VNV|1|A|C|71s53
7VNV|1|A|C|727VNV|1|A|C|720BPh
7VNV|1|A|C|727VNV|1|A|G|1cWW
7VNV|1|A|C|727VNV|1|A|G|2s55
7VNV|1|A|C|747VNV|1|A|A|73s53
7VNV|1|A|C|747VNV|1|A|C|740BPh
7VNV|1|A|C|747VNV|1|A|C|75s35
7VNV|1|A|C|757VNV|1|A|A|76s35
7VNV|1|A|C|757VNV|1|A|C|74s53
7VNV|1|A|C|757VNV|1|A|C|750BPh
7VNV|1|A|C|97VNV|1|A|G|23tHH
7VNV|1|A|C|97VNV|1|A|G|45s33
7VNV|1|A|C|97VNV|1|A|G|46s55
7VNV|1|A|G|17VNV|1|A|A|73s55
7VNV|1|A|G|17VNV|1|A|C|72cWW
7VNV|1|A|G|17VNV|1|A|G|1n0BP
7VNV|1|A|G|17VNV|1|A|G|2s35
7VNV|1|A|G|187VNV|1|A|G|180BPh
7VNV|1|A|G|27VNV|1|A|C|71cWW
7VNV|1|A|G|27VNV|1|A|C|72s55
7VNV|1|A|G|27VNV|1|A|G|1s53
7VNV|1|A|G|27VNV|1|A|G|20BPh
7VNV|1|A|G|27VNV|1|A|G|3s35
7VNV|1|A|G|227VNV|1|A|A|14s55
7VNV|1|A|G|227VNV|1|A|A|21
7VNV|1|A|G|227VNV|1|A|G|220BPh
7VNV|1|A|G|227VNV|1|A|G|23s35
7VNV|1|A|G|227VNV|1|A|G|46tHW
7VNV|1|A|G|237VNV|1|A|A|24s35
7VNV|1|A|G|237VNV|1|A|C|12cWW
7VNV|1|A|G|237VNV|1|A|C|9tHH
7VNV|1|A|G|237VNV|1|A|G|22s53
7VNV|1|A|G|237VNV|1|A|G|230BPh
7VNV|1|A|G|297VNV|1|A|C|28s53
7VNV|1|A|G|297VNV|1|A|C|30s35
7VNV|1|A|G|297VNV|1|A|C|41cWW
7VNV|1|A|G|297VNV|1|A|G|290BPh
7VNV|1|A|G|297VNV|1|A|G|42s55
7VNV|1|A|G|37VNV|1|A|C|4s35
7VNV|1|A|G|37VNV|1|A|C|70cWW
7VNV|1|A|G|37VNV|1|A|C|71s55
7VNV|1|A|G|37VNV|1|A|G|2s53
7VNV|1|A|G|37VNV|1|A|G|30BPh
7VNV|1|A|G|397VNV|1|A|A|38s53
7VNV|1|A|G|397VNV|1|A|C|31cWW
7VNV|1|A|G|397VNV|1|A|G|390BPh
7VNV|1|A|G|397VNV|1|A|G|40s35
7VNV|1|A|G|407VNV|1|A|C|30cWW
7VNV|1|A|G|407VNV|1|A|C|31s55
7VNV|1|A|G|407VNV|1|A|C|41s35
7VNV|1|A|G|407VNV|1|A|G|39s53
7VNV|1|A|G|407VNV|1|A|G|400BPh
7VNV|1|A|G|427VNV|1|A|C|28cWW
7VNV|1|A|G|427VNV|1|A|C|41s53
7VNV|1|A|G|427VNV|1|A|G|29s55
7VNV|1|A|G|427VNV|1|A|G|420BPh
7VNV|1|A|G|427VNV|1|A|G|43s35
7VNV|1|A|G|437VNV|1|A|A|44s35
7VNV|1|A|G|437VNV|1|A|C|27cWW
7VNV|1|A|G|437VNV|1|A|C|28s55
7VNV|1|A|G|437VNV|1|A|G|42s53
7VNV|1|A|G|437VNV|1|A|G|430BPh
7VNV|1|A|G|457VNV|1|A|A|44s53
7VNV|1|A|G|457VNV|1|A|C|9s33
7VNV|1|A|G|457VNV|1|A|G|450BPh
7VNV|1|A|G|467VNV|1|A|A|21s33
7VNV|1|A|G|467VNV|1|A|C|9s55
7VNV|1|A|G|467VNV|1|A|G|22tWH
7VNV|1|A|G|467VNV|1|A|G|46n0BP
7VNV|1|A|G|517VNV|1|A|A|64s55
7VNV|1|A|G|517VNV|1|A|C|63cWW
7VNV|1|A|G|517VNV|1|A|G|510BPh
7VNV|1|A|G|517VNV|1|A|G|52s35
7VNV|1|A|G|517VNV|1|A|U|50s53
7VNV|1|A|G|527VNV|1|A|C|62cWW
7VNV|1|A|G|527VNV|1|A|C|63s55
7VNV|1|A|G|527VNV|1|A|G|51s53
7VNV|1|A|G|527VNV|1|A|G|520BPh
7VNV|1|A|G|527VNV|1|A|G|53s35
7VNV|1|A|G|537VNV|1|A|C|61cWW
7VNV|1|A|G|537VNV|1|A|C|62s55
7VNV|1|A|G|537VNV|1|A|G|52s53
7VNV|1|A|G|537VNV|1|A|G|530BPh
7VNV|1|A|G|597VNV|1|A|C|16ntSS
7VNV|1|A|G|597VNV|1|A|G|59n0BP
7VNV|1|A|G|597VNV|1|A|U|60s35
7VNV|1|A|G|657VNV|1|A|A|64s53
7VNV|1|A|G|657VNV|1|A|C|66s35
7VNV|1|A|G|657VNV|1|A|G|650BPh
7VNV|1|A|G|657VNV|1|A|U|50s55
7VNV|1|A|G|677VNV|1|A|C|66s53
7VNV|1|A|G|677VNV|1|A|G|670BPh
7VNV|1|A|G|677VNV|1|A|G|68s35
7VNV|1|A|G|677VNV|1|A|G|7s55
7VNV|1|A|G|687VNV|1|A|C|5cWW
7VNV|1|A|G|687VNV|1|A|G|67s53
7VNV|1|A|G|687VNV|1|A|G|680BPh
7VNV|1|A|G|687VNV|1|A|G|69s35
7VNV|1|A|G|697VNV|1|A|C|4cWW
7VNV|1|A|G|697VNV|1|A|C|5s55
7VNV|1|A|G|697VNV|1|A|C|70s35
7VNV|1|A|G|697VNV|1|A|G|68s53
7VNV|1|A|G|697VNV|1|A|G|690BPh
7VNV|1|A|G|77VNV|1|A|C|66cWW
7VNV|1|A|G|77VNV|1|A|G|67s55
7VNV|1|A|G|77VNV|1|A|G|70BPh
7VNV|1|A|U|117VNV|1|A|A|24cWW
7VNV|1|A|U|117VNV|1|A|C|12s35
7VNV|1|A|U|117VNV|1|A|U|110BPh
7VNV|1|A|U|17|||a7VNV|1|A|U|17|||a0BPh
7VNV|1|A|U|17|||a7VNV|1|B|G|185BPh
7VNV|1|A|U|17|||a7VNV|1|B|U|17|||a
7VNV|1|A|U|207VNV|1|A|U|20n0BP
7VNV|1|A|U|207VNV|1|B|G|225BPh
7VNV|1|A|U|20|||a7VNV|1|A|U|20
7VNV|1|A|U|337VNV|1|A|C|36ntSH5BPh
7VNV|1|A|U|337VNV|1|A|U|330BPh
7VNV|1|A|U|507VNV|1|A|A|64cWW
7VNV|1|A|U|507VNV|1|A|G|51s35
7VNV|1|A|U|507VNV|1|A|G|65s55
7VNV|1|A|U|507VNV|1|A|U|500BPh
7VNV|1|A|U|607VNV|1|A|G|195BPh
7VNV|1|A|U|607VNV|1|A|G|59s53
7VNV|1|A|U|607VNV|1|A|U|600BPh
7VNV|1|B|A|147VNV|1|B|A|21cWS
7VNV|1|B|A|147VNV|1|B|G|22s55
7VNV|1|B|A|217VNV|1|B|A|14cSW
7VNV|1|B|A|217VNV|1|B|A|210BPh
7VNV|1|B|A|217VNV|1|B|C|9s35
7VNV|1|B|A|217VNV|1|B|G|46ntHS
7VNV|1|B|A|247VNV|1|B|A|240BPh
7VNV|1|B|A|247VNV|1|B|C|25s35
7VNV|1|B|A|247VNV|1|B|G|23s53
7VNV|1|B|A|247VNV|1|B|U|11cWW
7VNV|1|B|A|357VNV|1|B|A|35n0BP
7VNV|1|B|A|357VNV|1|B|C|36s35
7VNV|1|B|A|357VNV|1|B|U|33ns33
7VNV|1|B|A|377VNV|1|B|A|370BPh
7VNV|1|B|A|377VNV|1|B|A|38s35
7VNV|1|B|A|377VNV|1|B|C|36s53
7VNV|1|B|A|377VNV|1|B|U|33ntHS
7VNV|1|B|A|387VNV|1|B|A|37s53
7VNV|1|B|A|387VNV|1|B|A|38n0BP
7VNV|1|B|A|387VNV|1|B|G|39s35
7VNV|1|B|A|447VNV|1|B|A|440BPh
7VNV|1|B|A|447VNV|1|B|C|27ns55
7VNV|1|B|A|447VNV|1|B|G|43s53
7VNV|1|B|A|447VNV|1|B|G|45s35
7VNV|1|B|A|647VNV|1|B|A|640BPh
7VNV|1|B|A|647VNV|1|B|C|63s53
7VNV|1|B|A|647VNV|1|B|G|51s55
7VNV|1|B|A|647VNV|1|B|G|65s35
7VNV|1|B|A|647VNV|1|B|U|50cWW
7VNV|1|B|A|737VNV|1|B|A|730BPh
7VNV|1|B|A|737VNV|1|B|C|72s53
7VNV|1|B|A|737VNV|1|B|C|74s35
7VNV|1|B|A|737VNV|1|B|G|1s55
7VNV|1|B|A|767VNV|1|B|C|75
7VNV|1|B|C|127VNV|1|B|C|120BPh
7VNV|1|B|C|127VNV|1|B|G|23cWW
7VNV|1|B|C|127VNV|1|B|U|11s53
7VNV|1|B|C|167VNV|1|B|C|160BPh
7VNV|1|B|C|167VNV|1|B|G|59ntSS
7VNV|1|B|C|167VNV|1|B|G|76BPh
7VNV|1|B|C|257VNV|1|B|A|24s53
7VNV|1|B|C|257VNV|1|B|C|250BPh
7VNV|1|B|C|277VNV|1|B|A|44ns55
7VNV|1|B|C|277VNV|1|B|C|270BPh
7VNV|1|B|C|277VNV|1|B|C|28s35
7VNV|1|B|C|277VNV|1|B|G|43cWW
7VNV|1|B|C|287VNV|1|B|C|27s53
7VNV|1|B|C|287VNV|1|B|C|280BPh
7VNV|1|B|C|287VNV|1|B|G|29s35
7VNV|1|B|C|287VNV|1|B|G|42cWW
7VNV|1|B|C|287VNV|1|B|G|43s55
7VNV|1|B|C|307VNV|1|B|C|300BPh
7VNV|1|B|C|307VNV|1|B|C|31s35
7VNV|1|B|C|307VNV|1|B|G|29s53
7VNV|1|B|C|307VNV|1|B|G|40cWW
7VNV|1|B|C|317VNV|1|B|C|30s53
7VNV|1|B|C|317VNV|1|B|C|310BPh
7VNV|1|B|C|317VNV|1|B|G|39cWW
7VNV|1|B|C|317VNV|1|B|G|40s55
7VNV|1|B|C|367VNV|1|B|A|35s53
7VNV|1|B|C|367VNV|1|B|A|37s35
7VNV|1|B|C|367VNV|1|B|C|360BPh
7VNV|1|B|C|367VNV|1|B|U|33ntHS
7VNV|1|B|C|47VNV|1|B|C|40BPh
7VNV|1|B|C|47VNV|1|B|C|5s35
7VNV|1|B|C|47VNV|1|B|G|3s53
7VNV|1|B|C|47VNV|1|B|G|69cWW
7VNV|1|B|C|417VNV|1|B|C|410BPh
7VNV|1|B|C|417VNV|1|B|G|29cWW
7VNV|1|B|C|417VNV|1|B|G|40s53
7VNV|1|B|C|417VNV|1|B|G|42s35
7VNV|1|B|C|57VNV|1|B|C|4s53
7VNV|1|B|C|57VNV|1|B|C|50BPh
7VNV|1|B|C|57VNV|1|B|G|68cWW
7VNV|1|B|C|57VNV|1|B|G|69s55
7VNV|1|B|C|617VNV|1|B|C|610BPh
7VNV|1|B|C|617VNV|1|B|C|62s35
7VNV|1|B|C|617VNV|1|B|G|53cWW
7VNV|1|B|C|617VNV|1|B|U|608BPh
7VNV|1|B|C|627VNV|1|B|C|61s53
7VNV|1|B|C|627VNV|1|B|C|620BPh
7VNV|1|B|C|627VNV|1|B|C|63s35
7VNV|1|B|C|627VNV|1|B|G|52cWW
7VNV|1|B|C|627VNV|1|B|G|53s55
7VNV|1|B|C|637VNV|1|B|A|64s35
7VNV|1|B|C|637VNV|1|B|C|62s53
7VNV|1|B|C|637VNV|1|B|C|630BPh
7VNV|1|B|C|637VNV|1|B|G|51cWW
7VNV|1|B|C|637VNV|1|B|G|52s55
7VNV|1|B|C|667VNV|1|B|C|660BPh
7VNV|1|B|C|667VNV|1|B|G|65s53
7VNV|1|B|C|667VNV|1|B|G|67s35
7VNV|1|B|C|667VNV|1|B|G|7cWW
7VNV|1|B|C|707VNV|1|B|C|700BPh
7VNV|1|B|C|707VNV|1|B|C|71s35
7VNV|1|B|C|707VNV|1|B|G|3cWW
7VNV|1|B|C|707VNV|1|B|G|69s53
7VNV|1|B|C|717VNV|1|B|C|70s53
7VNV|1|B|C|717VNV|1|B|C|710BPh
7VNV|1|B|C|717VNV|1|B|C|72s35
7VNV|1|B|C|717VNV|1|B|G|2cWW
7VNV|1|B|C|717VNV|1|B|G|3s55
7VNV|1|B|C|727VNV|1|B|A|73s35
7VNV|1|B|C|727VNV|1|B|C|71s53
7VNV|1|B|C|727VNV|1|B|C|720BPh
7VNV|1|B|C|727VNV|1|B|G|1cWW
7VNV|1|B|C|727VNV|1|B|G|2s55
7VNV|1|B|C|747VNV|1|B|A|73s53
7VNV|1|B|C|747VNV|1|B|C|740BPh
7VNV|1|B|C|747VNV|1|B|C|75s35
7VNV|1|B|C|757VNV|1|B|C|74s53n9BP
7VNV|1|B|C|757VNV|1|B|C|750BPh
7VNV|1|B|C|97VNV|1|B|A|21s53
7VNV|1|B|C|97VNV|1|B|C|9n0BP
7VNV|1|B|C|97VNV|1|B|G|22ntHH
7VNV|1|B|G|17VNV|1|B|A|73s55
7VNV|1|B|G|17VNV|1|B|C|72cWW
7VNV|1|B|G|17VNV|1|B|G|10BPh
7VNV|1|B|G|17VNV|1|B|G|2s35
7VNV|1|B|G|187VNV|1|B|G|180BPh
7VNV|1|B|G|197VNV|1|B|G|19n0BP
7VNV|1|B|G|27VNV|1|B|C|71cWW
7VNV|1|B|G|27VNV|1|B|C|72s55
7VNV|1|B|G|27VNV|1|B|G|1s53
7VNV|1|B|G|27VNV|1|B|G|20BPh
7VNV|1|B|G|27VNV|1|B|G|3s35
7VNV|1|B|G|227VNV|1|B|A|14s55
7VNV|1|B|G|227VNV|1|B|C|9ntHH
7VNV|1|B|G|227VNV|1|B|G|220BPh
7VNV|1|B|G|227VNV|1|B|G|23s35
7VNV|1|B|G|237VNV|1|B|A|24s35
7VNV|1|B|G|237VNV|1|B|C|12cWW
7VNV|1|B|G|237VNV|1|B|G|22s53
7VNV|1|B|G|237VNV|1|B|G|230BPh
7VNV|1|B|G|297VNV|1|B|C|28s53
7VNV|1|B|G|297VNV|1|B|C|30s35
7VNV|1|B|G|297VNV|1|B|C|41cWW
7VNV|1|B|G|297VNV|1|B|G|290BPh
7VNV|1|B|G|297VNV|1|B|G|42s55
7VNV|1|B|G|37VNV|1|B|C|4s35
7VNV|1|B|G|37VNV|1|B|C|70cWW
7VNV|1|B|G|37VNV|1|B|C|71s55
7VNV|1|B|G|37VNV|1|B|G|2s53
7VNV|1|B|G|37VNV|1|B|G|30BPh
7VNV|1|B|G|397VNV|1|B|A|38s53
7VNV|1|B|G|397VNV|1|B|C|31cWW
7VNV|1|B|G|397VNV|1|B|G|390BPh
7VNV|1|B|G|397VNV|1|B|G|40s35
7VNV|1|B|G|407VNV|1|B|C|30cWW
7VNV|1|B|G|407VNV|1|B|C|31s55
7VNV|1|B|G|407VNV|1|B|C|41s35
7VNV|1|B|G|407VNV|1|B|G|39s53
7VNV|1|B|G|407VNV|1|B|G|400BPh
7VNV|1|B|G|427VNV|1|B|C|28cWW
7VNV|1|B|G|427VNV|1|B|C|41s53
7VNV|1|B|G|427VNV|1|B|G|29s55
7VNV|1|B|G|427VNV|1|B|G|420BPh
7VNV|1|B|G|427VNV|1|B|G|43s35
7VNV|1|B|G|437VNV|1|B|A|44s35
7VNV|1|B|G|437VNV|1|B|C|27cWW
7VNV|1|B|G|437VNV|1|B|C|28s55
7VNV|1|B|G|437VNV|1|B|G|42s53
7VNV|1|B|G|437VNV|1|B|G|430BPh
7VNV|1|B|G|457VNV|1|B|A|44s53
7VNV|1|B|G|457VNV|1|B|G|450BPh
7VNV|1|B|G|467VNV|1|B|A|21ntSH3BPh
7VNV|1|B|G|467VNV|1|B|G|46n0BP
7VNV|1|B|G|517VNV|1|B|A|64s55
7VNV|1|B|G|517VNV|1|B|C|63cWW
7VNV|1|B|G|517VNV|1|B|G|510BPh
7VNV|1|B|G|517VNV|1|B|G|52s35
7VNV|1|B|G|517VNV|1|B|U|50s53
7VNV|1|B|G|527VNV|1|B|C|62cWW
7VNV|1|B|G|527VNV|1|B|C|63s55
7VNV|1|B|G|527VNV|1|B|G|51s53
7VNV|1|B|G|527VNV|1|B|G|520BPh
7VNV|1|B|G|527VNV|1|B|G|53s35
7VNV|1|B|G|537VNV|1|B|C|61cWW
7VNV|1|B|G|537VNV|1|B|C|62s55
7VNV|1|B|G|537VNV|1|B|G|52s53
7VNV|1|B|G|537VNV|1|B|G|530BPh
7VNV|1|B|G|597VNV|1|B|C|16ntSS
7VNV|1|B|G|597VNV|1|B|G|59n0BP
7VNV|1|B|G|597VNV|1|B|U|60s35
7VNV|1|B|G|657VNV|1|B|A|64s53
7VNV|1|B|G|657VNV|1|B|C|66s35
7VNV|1|B|G|657VNV|1|B|G|650BPh
7VNV|1|B|G|657VNV|1|B|U|50s55
7VNV|1|B|G|677VNV|1|B|C|66s53
7VNV|1|B|G|677VNV|1|B|G|670BPh
7VNV|1|B|G|677VNV|1|B|G|68s35
7VNV|1|B|G|677VNV|1|B|G|7s55
7VNV|1|B|G|687VNV|1|B|C|5cWW
7VNV|1|B|G|687VNV|1|B|G|67s53
7VNV|1|B|G|687VNV|1|B|G|680BPh
7VNV|1|B|G|687VNV|1|B|G|69s35
7VNV|1|B|G|697VNV|1|B|C|4cWW
7VNV|1|B|G|697VNV|1|B|C|5s55
7VNV|1|B|G|697VNV|1|B|C|70s35
7VNV|1|B|G|697VNV|1|B|G|68s53
7VNV|1|B|G|697VNV|1|B|G|690BPh
7VNV|1|B|G|77VNV|1|B|C|66cWW
7VNV|1|B|G|77VNV|1|B|G|67s55
7VNV|1|B|G|77VNV|1|B|G|70BPh
7VNV|1|B|U|117VNV|1|B|A|24cWW
7VNV|1|B|U|117VNV|1|B|C|12s35
7VNV|1|B|U|117VNV|1|B|U|110BPh
7VNV|1|B|U|17|||a7VNV|1|A|G|185BPh
7VNV|1|B|U|17|||a7VNV|1|A|U|17|||a
7VNV|1|B|U|17|||a7VNV|1|B|U|17|||a0BPh
7VNV|1|B|U|207VNV|1|B|U|20|||an0BP
7VNV|1|B|U|337VNV|1|B|A|35ns33
7VNV|1|B|U|337VNV|1|B|A|37ntSH
7VNV|1|B|U|337VNV|1|B|C|36ntSH5BPh
7VNV|1|B|U|337VNV|1|B|U|330BPh
7VNV|1|B|U|507VNV|1|B|A|64cWW
7VNV|1|B|U|507VNV|1|B|G|51s35
7VNV|1|B|U|507VNV|1|B|G|65s55
7VNV|1|B|U|507VNV|1|B|U|500BPh
7VNV|1|B|U|607VNV|1|B|G|195BPh
7VNV|1|B|U|607VNV|1|B|G|59s53n9BP
7VNV|1|B|U|607VNV|1|B|U|600BPh


Base-PairsCount (37)Relative Frequency
cWW340.919
tWH10.027
cWS10.027
tHH10.027
Base-PhosphateCount (114)Relative Frequency
3BPh10.009
5BPh70.061
6BPh20.018
8BPh20.018
0BPh1020.895
Base-StackingCount (54)Relative Frequency
s3320.037
s53250.463
s55270.500

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)