A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 12-Aug-2022 number of released structures: 12231
Search for released structures

NDB ID: 7VNW  PDB ID: 7VNW 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7VNW|1|A|A|147VNW|1|A|A|21ncWS
7VNW|1|A|A|147VNW|1|A|G|22s55
7VNW|1|A|A|147VNW|1|A|U|8tHW
7VNW|1|A|A|217VNW|1|A|A|14ncSW
7VNW|1|A|A|217VNW|1|A|A|210BPh
7VNW|1|A|A|217VNW|1|A|G|46s33
7VNW|1|A|A|217VNW|1|A|U|8ntSS
7VNW|1|A|A|247VNW|1|A|A|240BPh
7VNW|1|A|A|247VNW|1|A|C|12ns55
7VNW|1|A|A|247VNW|1|A|C|25s35
7VNW|1|A|A|247VNW|1|A|G|23s53
7VNW|1|A|A|247VNW|1|A|U|11cWW
7VNW|1|A|A|357VNW|1|A|A|350BPh
7VNW|1|A|A|357VNW|1|A|C|36s35
7VNW|1|A|A|377VNW|1|A|A|370BPh
7VNW|1|A|A|377VNW|1|A|A|38s35
7VNW|1|A|A|377VNW|1|A|C|36s53
7VNW|1|A|A|387VNW|1|A|A|37s53
7VNW|1|A|A|387VNW|1|A|A|38n0BP
7VNW|1|A|A|387VNW|1|A|G|39s35
7VNW|1|A|A|447VNW|1|A|A|440BPh
7VNW|1|A|A|447VNW|1|A|G|43s53
7VNW|1|A|A|447VNW|1|A|G|45s35
7VNW|1|A|A|647VNW|1|A|A|640BPh
7VNW|1|A|A|647VNW|1|A|C|63s53
7VNW|1|A|A|647VNW|1|A|G|51s55
7VNW|1|A|A|647VNW|1|A|G|65s35
7VNW|1|A|A|647VNW|1|A|U|50cWW
7VNW|1|A|A|737VNW|1|A|A|730BPh
7VNW|1|A|A|737VNW|1|A|C|72s53
7VNW|1|A|A|737VNW|1|A|C|74s35
7VNW|1|A|A|737VNW|1|A|G|1s55
7VNW|1|A|A|767VNW|1|A|A|760BPh
7VNW|1|A|A|767VNW|1|A|C|75s53
7VNW|1|A|C|127VNW|1|A|A|24ns55
7VNW|1|A|C|127VNW|1|A|C|120BPh
7VNW|1|A|C|127VNW|1|A|G|23cWW
7VNW|1|A|C|127VNW|1|A|U|11s53
7VNW|1|A|C|167VNW|1|A|G|59ntSS
7VNW|1|A|C|167VNW|1|A|G|76BPh
7VNW|1|A|C|257VNW|1|A|A|24s53
7VNW|1|A|C|257VNW|1|A|C|250BPh
7VNW|1|A|C|277VNW|1|A|C|270BPh
7VNW|1|A|C|277VNW|1|A|C|28s35
7VNW|1|A|C|277VNW|1|A|G|43cWW
7VNW|1|A|C|287VNW|1|A|C|27s53
7VNW|1|A|C|287VNW|1|A|C|280BPh
7VNW|1|A|C|287VNW|1|A|G|29s35
7VNW|1|A|C|287VNW|1|A|G|42cWW
7VNW|1|A|C|287VNW|1|A|G|43s55
7VNW|1|A|C|307VNW|1|A|C|300BPh
7VNW|1|A|C|307VNW|1|A|C|31s35
7VNW|1|A|C|307VNW|1|A|G|29s53
7VNW|1|A|C|307VNW|1|A|G|40cWW
7VNW|1|A|C|317VNW|1|A|C|30s53
7VNW|1|A|C|317VNW|1|A|C|310BPh
7VNW|1|A|C|317VNW|1|A|G|39cWW
7VNW|1|A|C|317VNW|1|A|G|40s55
7VNW|1|A|C|367VNW|1|A|A|35s53
7VNW|1|A|C|367VNW|1|A|A|37s35
7VNW|1|A|C|367VNW|1|A|C|360BPh
7VNW|1|A|C|367VNW|1|A|U|33ntHS
7VNW|1|A|C|47VNW|1|A|C|40BPh
7VNW|1|A|C|47VNW|1|A|C|5s35
7VNW|1|A|C|47VNW|1|A|G|3s53
7VNW|1|A|C|47VNW|1|A|G|69cWW
7VNW|1|A|C|417VNW|1|A|C|410BPh
7VNW|1|A|C|417VNW|1|A|G|29cWW
7VNW|1|A|C|417VNW|1|A|G|40s53
7VNW|1|A|C|417VNW|1|A|G|42s35
7VNW|1|A|C|57VNW|1|A|C|4s53
7VNW|1|A|C|57VNW|1|A|G|68cWW
7VNW|1|A|C|57VNW|1|A|G|69s55
7VNW|1|A|C|617VNW|1|A|C|610BPh
7VNW|1|A|C|617VNW|1|A|C|62s35
7VNW|1|A|C|617VNW|1|A|G|53cWW
7VNW|1|A|C|617VNW|1|A|U|608BPh
7VNW|1|A|C|627VNW|1|A|C|61s53
7VNW|1|A|C|627VNW|1|A|C|620BPh
7VNW|1|A|C|627VNW|1|A|C|63s35
7VNW|1|A|C|627VNW|1|A|G|52cWW
7VNW|1|A|C|627VNW|1|A|G|53s55
7VNW|1|A|C|637VNW|1|A|A|64s35
7VNW|1|A|C|637VNW|1|A|C|62s53
7VNW|1|A|C|637VNW|1|A|C|630BPh
7VNW|1|A|C|637VNW|1|A|G|51cWW
7VNW|1|A|C|637VNW|1|A|G|52s55
7VNW|1|A|C|667VNW|1|A|C|660BPh
7VNW|1|A|C|667VNW|1|A|G|65s53
7VNW|1|A|C|667VNW|1|A|G|67s35
7VNW|1|A|C|667VNW|1|A|G|7cWW
7VNW|1|A|C|707VNW|1|A|C|700BPh
7VNW|1|A|C|707VNW|1|A|C|71s35
7VNW|1|A|C|707VNW|1|A|G|3cWW
7VNW|1|A|C|707VNW|1|A|G|69s53
7VNW|1|A|C|717VNW|1|A|C|70s53
7VNW|1|A|C|717VNW|1|A|C|710BPh
7VNW|1|A|C|717VNW|1|A|C|72s35
7VNW|1|A|C|717VNW|1|A|G|2cWW
7VNW|1|A|C|717VNW|1|A|G|3s55
7VNW|1|A|C|727VNW|1|A|A|73s35
7VNW|1|A|C|727VNW|1|A|C|71s53
7VNW|1|A|C|727VNW|1|A|C|720BPh
7VNW|1|A|C|727VNW|1|A|G|1cWW
7VNW|1|A|C|727VNW|1|A|G|2s55
7VNW|1|A|C|747VNW|1|A|A|73s53
7VNW|1|A|C|747VNW|1|A|C|740BPh
7VNW|1|A|C|747VNW|1|A|C|75s35
7VNW|1|A|C|757VNW|1|A|A|76s35
7VNW|1|A|C|757VNW|1|A|C|74s53
7VNW|1|A|C|757VNW|1|A|C|750BPh
7VNW|1|A|C|97VNW|1|A|G|23tHH
7VNW|1|A|C|97VNW|1|A|G|45s33
7VNW|1|A|C|97VNW|1|A|G|46s55
7VNW|1|A|G|17VNW|1|A|A|73s55
7VNW|1|A|G|17VNW|1|A|C|72cWW
7VNW|1|A|G|17VNW|1|A|G|1n0BP
7VNW|1|A|G|17VNW|1|A|G|2s35
7VNW|1|A|G|187VNW|1|A|G|180BPh
7VNW|1|A|G|27VNW|1|A|C|71cWW
7VNW|1|A|G|27VNW|1|A|C|72s55
7VNW|1|A|G|27VNW|1|A|G|1s53
7VNW|1|A|G|27VNW|1|A|G|20BPh
7VNW|1|A|G|27VNW|1|A|G|3s35
7VNW|1|A|G|227VNW|1|A|A|14s55
7VNW|1|A|G|227VNW|1|A|G|220BPh
7VNW|1|A|G|227VNW|1|A|G|23s35
7VNW|1|A|G|227VNW|1|A|G|46ntHW
7VNW|1|A|G|237VNW|1|A|A|24s35
7VNW|1|A|G|237VNW|1|A|C|12cWW
7VNW|1|A|G|237VNW|1|A|C|9tHH
7VNW|1|A|G|237VNW|1|A|G|22s53
7VNW|1|A|G|237VNW|1|A|G|230BPh
7VNW|1|A|G|297VNW|1|A|C|28s53
7VNW|1|A|G|297VNW|1|A|C|30s35
7VNW|1|A|G|297VNW|1|A|C|41cWW
7VNW|1|A|G|297VNW|1|A|G|290BPh
7VNW|1|A|G|297VNW|1|A|G|42s55
7VNW|1|A|G|37VNW|1|A|C|4s35
7VNW|1|A|G|37VNW|1|A|C|70cWW
7VNW|1|A|G|37VNW|1|A|C|71s55
7VNW|1|A|G|37VNW|1|A|G|2s53
7VNW|1|A|G|37VNW|1|A|G|30BPh
7VNW|1|A|G|397VNW|1|A|A|38s53
7VNW|1|A|G|397VNW|1|A|C|31cWW
7VNW|1|A|G|397VNW|1|A|G|390BPh
7VNW|1|A|G|397VNW|1|A|G|40s35
7VNW|1|A|G|407VNW|1|A|C|30cWW
7VNW|1|A|G|407VNW|1|A|C|31s55
7VNW|1|A|G|407VNW|1|A|C|41s35
7VNW|1|A|G|407VNW|1|A|G|39s53
7VNW|1|A|G|407VNW|1|A|G|400BPh
7VNW|1|A|G|427VNW|1|A|C|28cWW
7VNW|1|A|G|427VNW|1|A|C|41s53
7VNW|1|A|G|427VNW|1|A|G|29s55
7VNW|1|A|G|427VNW|1|A|G|420BPh
7VNW|1|A|G|427VNW|1|A|G|43s35
7VNW|1|A|G|437VNW|1|A|A|44s35
7VNW|1|A|G|437VNW|1|A|C|27cWW
7VNW|1|A|G|437VNW|1|A|C|28s55
7VNW|1|A|G|437VNW|1|A|G|42s53
7VNW|1|A|G|437VNW|1|A|G|430BPh
7VNW|1|A|G|457VNW|1|A|A|44s53
7VNW|1|A|G|457VNW|1|A|C|9s33
7VNW|1|A|G|457VNW|1|A|G|450BPh
7VNW|1|A|G|457VNW|1|A|U|11ncSH
7VNW|1|A|G|467VNW|1|A|A|21s33
7VNW|1|A|G|467VNW|1|A|C|9s55
7VNW|1|A|G|467VNW|1|A|G|22ntWH
7VNW|1|A|G|467VNW|1|A|G|46n0BP
7VNW|1|A|G|517VNW|1|A|A|64s55
7VNW|1|A|G|517VNW|1|A|C|63cWW
7VNW|1|A|G|517VNW|1|A|G|510BPh
7VNW|1|A|G|517VNW|1|A|G|52s35
7VNW|1|A|G|517VNW|1|A|U|50ns53
7VNW|1|A|G|527VNW|1|A|C|62cWW
7VNW|1|A|G|527VNW|1|A|C|63s55
7VNW|1|A|G|527VNW|1|A|G|51s53
7VNW|1|A|G|527VNW|1|A|G|520BPh
7VNW|1|A|G|527VNW|1|A|G|53s35
7VNW|1|A|G|537VNW|1|A|C|61cWW
7VNW|1|A|G|537VNW|1|A|C|62s55
7VNW|1|A|G|537VNW|1|A|G|52s53
7VNW|1|A|G|537VNW|1|A|G|530BPh
7VNW|1|A|G|537VNW|1|A|U|54s35
7VNW|1|A|G|597VNW|1|A|C|16ntSS
7VNW|1|A|G|597VNW|1|A|G|590BPh
7VNW|1|A|G|597VNW|1|A|U|60s35
7VNW|1|A|G|657VNW|1|A|A|64s53
7VNW|1|A|G|657VNW|1|A|C|66s35
7VNW|1|A|G|657VNW|1|A|G|650BPh
7VNW|1|A|G|657VNW|1|A|U|50s55
7VNW|1|A|G|677VNW|1|A|C|66s53
7VNW|1|A|G|677VNW|1|A|G|670BPh
7VNW|1|A|G|677VNW|1|A|G|68s35
7VNW|1|A|G|677VNW|1|A|G|7s55
7VNW|1|A|G|687VNW|1|A|C|5cWW
7VNW|1|A|G|687VNW|1|A|G|67s53
7VNW|1|A|G|687VNW|1|A|G|680BPh
7VNW|1|A|G|687VNW|1|A|G|69s35
7VNW|1|A|G|697VNW|1|A|C|4cWW
7VNW|1|A|G|697VNW|1|A|C|5s55
7VNW|1|A|G|697VNW|1|A|C|70s35
7VNW|1|A|G|697VNW|1|A|G|68s53
7VNW|1|A|G|697VNW|1|A|G|690BPh
7VNW|1|A|G|77VNW|1|A|C|66cWW
7VNW|1|A|G|77VNW|1|A|G|67s55
7VNW|1|A|G|77VNW|1|A|G|70BPh
7VNW|1|A|U|117VNW|1|A|A|24cWW
7VNW|1|A|U|117VNW|1|A|C|12s35
7VNW|1|A|U|117VNW|1|A|G|45ncHS
7VNW|1|A|U|117VNW|1|A|U|110BPh
7VNW|1|A|U|17|||a7VNW|1|A|U|17|||a0BPh
7VNW|1|A|U|17|||a7VNW|1|B|G|185BPh
7VNW|1|A|U|207VNW|1|A|U|20
7VNW|1|A|U|20|||a7VNW|1|A|U|20
7VNW|1|A|U|337VNW|1|A|C|36ntSH5BPh
7VNW|1|A|U|337VNW|1|A|U|330BPh
7VNW|1|A|U|507VNW|1|A|A|64cWW
7VNW|1|A|U|507VNW|1|A|G|51ns35
7VNW|1|A|U|507VNW|1|A|G|65s55
7VNW|1|A|U|507VNW|1|A|U|500BPh
7VNW|1|A|U|547VNW|1|A|G|53s53
7VNW|1|A|U|547VNW|1|A|U|540BPh
7VNW|1|A|U|607VNW|1|A|G|195BPh
7VNW|1|A|U|607VNW|1|A|G|59s53
7VNW|1|A|U|607VNW|1|A|U|600BPh
7VNW|1|A|U|87VNW|1|A|A|14tWH
7VNW|1|A|U|87VNW|1|A|A|21ntSS
7VNW|1|A|U|87VNW|1|A|U|80BPh
7VNW|1|B|A|147VNW|1|B|A|21cWS
7VNW|1|B|A|147VNW|1|B|G|22s55
7VNW|1|B|A|147VNW|1|B|U|8tHW
7VNW|1|B|A|217VNW|1|B|A|14cSW
7VNW|1|B|A|217VNW|1|B|A|210BPh
7VNW|1|B|A|217VNW|1|B|G|46s33
7VNW|1|B|A|217VNW|1|B|U|8tSS
7VNW|1|B|A|247VNW|1|B|A|240BPh
7VNW|1|B|A|247VNW|1|B|C|12ns55
7VNW|1|B|A|247VNW|1|B|C|25s35
7VNW|1|B|A|247VNW|1|B|G|23s53
7VNW|1|B|A|247VNW|1|B|U|11cWW
7VNW|1|B|A|357VNW|1|B|A|350BPh
7VNW|1|B|A|357VNW|1|B|C|36s35
7VNW|1|B|A|357VNW|1|B|U|33ntHS
7VNW|1|B|A|377VNW|1|B|A|38s35
7VNW|1|B|A|377VNW|1|B|C|36s53
7VNW|1|B|A|387VNW|1|B|A|37s53
7VNW|1|B|A|387VNW|1|B|A|380BPh
7VNW|1|B|A|387VNW|1|B|G|39s35
7VNW|1|B|A|447VNW|1|B|A|440BPh
7VNW|1|B|A|447VNW|1|B|G|43s53
7VNW|1|B|A|447VNW|1|B|G|45s35
7VNW|1|B|A|647VNW|1|B|A|640BPh
7VNW|1|B|A|647VNW|1|B|C|63s53
7VNW|1|B|A|647VNW|1|B|G|51s55
7VNW|1|B|A|647VNW|1|B|G|65s35
7VNW|1|B|A|647VNW|1|B|U|50cWW
7VNW|1|B|A|737VNW|1|B|A|730BPh
7VNW|1|B|A|737VNW|1|B|C|72s53
7VNW|1|B|A|737VNW|1|B|C|74s35
7VNW|1|B|A|737VNW|1|B|G|1s55
7VNW|1|B|A|767VNW|1|B|C|74
7VNW|1|B|A|767VNW|1|B|C|75
7VNW|1|B|C|127VNW|1|B|A|24ns55
7VNW|1|B|C|127VNW|1|B|C|120BPh
7VNW|1|B|C|127VNW|1|B|G|23cWW
7VNW|1|B|C|127VNW|1|B|U|11s53
7VNW|1|B|C|167VNW|1|B|C|16n0BP
7VNW|1|B|C|167VNW|1|B|G|59ntSS
7VNW|1|B|C|167VNW|1|B|G|76BPh
7VNW|1|B|C|257VNW|1|B|A|24s53
7VNW|1|B|C|257VNW|1|B|C|250BPh
7VNW|1|B|C|277VNW|1|B|C|270BPh
7VNW|1|B|C|277VNW|1|B|C|28s35
7VNW|1|B|C|277VNW|1|B|G|43cWW
7VNW|1|B|C|287VNW|1|B|C|27s53
7VNW|1|B|C|287VNW|1|B|C|280BPh
7VNW|1|B|C|287VNW|1|B|G|29s35
7VNW|1|B|C|287VNW|1|B|G|42cWW
7VNW|1|B|C|287VNW|1|B|G|43s55
7VNW|1|B|C|307VNW|1|B|C|300BPh
7VNW|1|B|C|307VNW|1|B|C|31s35
7VNW|1|B|C|307VNW|1|B|G|29s53
7VNW|1|B|C|307VNW|1|B|G|40cWW
7VNW|1|B|C|317VNW|1|B|C|30s53
7VNW|1|B|C|317VNW|1|B|C|310BPh
7VNW|1|B|C|317VNW|1|B|G|39cWW
7VNW|1|B|C|317VNW|1|B|G|40s55
7VNW|1|B|C|367VNW|1|B|A|35s53
7VNW|1|B|C|367VNW|1|B|A|37s35
7VNW|1|B|C|367VNW|1|B|C|36n0BP
7VNW|1|B|C|367VNW|1|B|U|33ntHS
7VNW|1|B|C|47VNW|1|B|C|40BPh
7VNW|1|B|C|47VNW|1|B|C|5s35
7VNW|1|B|C|47VNW|1|B|G|3s53
7VNW|1|B|C|47VNW|1|B|G|69cWW
7VNW|1|B|C|417VNW|1|B|C|410BPh
7VNW|1|B|C|417VNW|1|B|G|29cWW
7VNW|1|B|C|417VNW|1|B|G|40s53
7VNW|1|B|C|417VNW|1|B|G|42s35
7VNW|1|B|C|57VNW|1|B|C|4s53
7VNW|1|B|C|57VNW|1|B|C|50BPh
7VNW|1|B|C|57VNW|1|B|G|68cWW
7VNW|1|B|C|57VNW|1|B|G|69s55
7VNW|1|B|C|617VNW|1|B|C|610BPh
7VNW|1|B|C|617VNW|1|B|C|62s35
7VNW|1|B|C|617VNW|1|B|G|53cWW
7VNW|1|B|C|617VNW|1|B|U|608BPh
7VNW|1|B|C|627VNW|1|B|C|61s53
7VNW|1|B|C|627VNW|1|B|C|620BPh
7VNW|1|B|C|627VNW|1|B|C|63s35
7VNW|1|B|C|627VNW|1|B|G|52cWW
7VNW|1|B|C|627VNW|1|B|G|53s55
7VNW|1|B|C|637VNW|1|B|A|64s35
7VNW|1|B|C|637VNW|1|B|C|62s53
7VNW|1|B|C|637VNW|1|B|C|630BPh
7VNW|1|B|C|637VNW|1|B|G|51cWW
7VNW|1|B|C|637VNW|1|B|G|52s55
7VNW|1|B|C|667VNW|1|B|C|660BPh
7VNW|1|B|C|667VNW|1|B|G|65s53
7VNW|1|B|C|667VNW|1|B|G|67s35
7VNW|1|B|C|667VNW|1|B|G|7cWW
7VNW|1|B|C|707VNW|1|B|C|700BPh
7VNW|1|B|C|707VNW|1|B|C|71s35
7VNW|1|B|C|707VNW|1|B|G|3cWW
7VNW|1|B|C|707VNW|1|B|G|69s53
7VNW|1|B|C|717VNW|1|B|C|70s53
7VNW|1|B|C|717VNW|1|B|C|710BPh
7VNW|1|B|C|717VNW|1|B|C|72s35
7VNW|1|B|C|717VNW|1|B|G|2cWW
7VNW|1|B|C|717VNW|1|B|G|3s55
7VNW|1|B|C|727VNW|1|B|A|73s35
7VNW|1|B|C|727VNW|1|B|C|71s53
7VNW|1|B|C|727VNW|1|B|C|720BPh
7VNW|1|B|C|727VNW|1|B|G|1cWW
7VNW|1|B|C|727VNW|1|B|G|2s55
7VNW|1|B|C|747VNW|1|B|A|73s53
7VNW|1|B|C|747VNW|1|B|C|740BPh
7VNW|1|B|C|747VNW|1|B|C|75s35
7VNW|1|B|C|757VNW|1|B|C|74s53n9BP
7VNW|1|B|C|757VNW|1|B|C|750BPh
7VNW|1|B|C|97VNW|1|B|G|23ntHH
7VNW|1|B|C|97VNW|1|B|G|45s33
7VNW|1|B|C|97VNW|1|B|G|46s55
7VNW|1|B|G|17VNW|1|B|A|73s55
7VNW|1|B|G|17VNW|1|B|C|72cWW
7VNW|1|B|G|17VNW|1|B|G|10BPh
7VNW|1|B|G|17VNW|1|B|G|2s35
7VNW|1|B|G|187VNW|1|B|G|180BPh
7VNW|1|B|G|197VNW|1|B|G|19n0BP
7VNW|1|B|G|27VNW|1|B|C|71cWW
7VNW|1|B|G|27VNW|1|B|C|72s55
7VNW|1|B|G|27VNW|1|B|G|1s53
7VNW|1|B|G|27VNW|1|B|G|20BPh
7VNW|1|B|G|27VNW|1|B|G|3s35
7VNW|1|B|G|227VNW|1|B|A|14s55
7VNW|1|B|G|227VNW|1|B|A|21
7VNW|1|B|G|227VNW|1|B|G|220BPh
7VNW|1|B|G|227VNW|1|B|G|23s35
7VNW|1|B|G|227VNW|1|B|G|46ntHW
7VNW|1|B|G|237VNW|1|B|A|24s35
7VNW|1|B|G|237VNW|1|B|C|12cWW
7VNW|1|B|G|237VNW|1|B|C|9ntHH
7VNW|1|B|G|237VNW|1|B|G|22s53
7VNW|1|B|G|237VNW|1|B|G|230BPh
7VNW|1|B|G|297VNW|1|B|C|28s53
7VNW|1|B|G|297VNW|1|B|C|30s35
7VNW|1|B|G|297VNW|1|B|C|41cWW
7VNW|1|B|G|297VNW|1|B|G|290BPh
7VNW|1|B|G|297VNW|1|B|G|42s55
7VNW|1|B|G|37VNW|1|B|C|4s35
7VNW|1|B|G|37VNW|1|B|C|70cWW
7VNW|1|B|G|37VNW|1|B|C|71s55
7VNW|1|B|G|37VNW|1|B|G|2s53
7VNW|1|B|G|37VNW|1|B|G|30BPh
7VNW|1|B|G|397VNW|1|B|A|38s53
7VNW|1|B|G|397VNW|1|B|C|31cWW
7VNW|1|B|G|397VNW|1|B|G|390BPh
7VNW|1|B|G|397VNW|1|B|G|40s35
7VNW|1|B|G|407VNW|1|B|C|30cWW
7VNW|1|B|G|407VNW|1|B|C|31s55
7VNW|1|B|G|407VNW|1|B|C|41s35
7VNW|1|B|G|407VNW|1|B|G|39s53
7VNW|1|B|G|407VNW|1|B|G|400BPh
7VNW|1|B|G|427VNW|1|B|C|28cWW
7VNW|1|B|G|427VNW|1|B|C|41s53
7VNW|1|B|G|427VNW|1|B|G|29s55
7VNW|1|B|G|427VNW|1|B|G|420BPh
7VNW|1|B|G|427VNW|1|B|G|43s35
7VNW|1|B|G|437VNW|1|B|A|44s35
7VNW|1|B|G|437VNW|1|B|C|27cWW
7VNW|1|B|G|437VNW|1|B|C|28s55
7VNW|1|B|G|437VNW|1|B|G|42s53
7VNW|1|B|G|437VNW|1|B|G|430BPh
7VNW|1|B|G|457VNW|1|B|A|44s53
7VNW|1|B|G|457VNW|1|B|C|9s33
7VNW|1|B|G|457VNW|1|B|G|450BPh
7VNW|1|B|G|467VNW|1|B|A|21s33
7VNW|1|B|G|467VNW|1|B|C|9s55
7VNW|1|B|G|467VNW|1|B|G|22ntWH
7VNW|1|B|G|517VNW|1|B|A|64s55
7VNW|1|B|G|517VNW|1|B|C|63cWW
7VNW|1|B|G|517VNW|1|B|G|510BPh
7VNW|1|B|G|517VNW|1|B|G|52s35
7VNW|1|B|G|517VNW|1|B|U|50s53
7VNW|1|B|G|527VNW|1|B|C|62cWW
7VNW|1|B|G|527VNW|1|B|C|63s55
7VNW|1|B|G|527VNW|1|B|G|51s53
7VNW|1|B|G|527VNW|1|B|G|520BPh
7VNW|1|B|G|527VNW|1|B|G|53s35
7VNW|1|B|G|537VNW|1|B|C|61cWW
7VNW|1|B|G|537VNW|1|B|C|62s55
7VNW|1|B|G|537VNW|1|B|G|52s53
7VNW|1|B|G|537VNW|1|B|G|530BPh
7VNW|1|B|G|537VNW|1|B|U|54s35
7VNW|1|B|G|597VNW|1|B|C|16ntSS
7VNW|1|B|G|597VNW|1|B|G|590BPh
7VNW|1|B|G|597VNW|1|B|U|60s35
7VNW|1|B|G|657VNW|1|B|A|64s53
7VNW|1|B|G|657VNW|1|B|C|66s35
7VNW|1|B|G|657VNW|1|B|G|650BPh
7VNW|1|B|G|657VNW|1|B|U|50s55
7VNW|1|B|G|677VNW|1|B|C|66s53
7VNW|1|B|G|677VNW|1|B|G|670BPh
7VNW|1|B|G|677VNW|1|B|G|68s35
7VNW|1|B|G|677VNW|1|B|G|7s55
7VNW|1|B|G|687VNW|1|B|C|5cWW
7VNW|1|B|G|687VNW|1|B|G|67s53
7VNW|1|B|G|687VNW|1|B|G|680BPh
7VNW|1|B|G|687VNW|1|B|G|69s35
7VNW|1|B|G|697VNW|1|B|C|4cWW
7VNW|1|B|G|697VNW|1|B|C|5s55
7VNW|1|B|G|697VNW|1|B|C|70s35
7VNW|1|B|G|697VNW|1|B|G|68s53
7VNW|1|B|G|697VNW|1|B|G|690BPh
7VNW|1|B|G|77VNW|1|B|C|66cWW
7VNW|1|B|G|77VNW|1|B|G|67s55
7VNW|1|B|G|77VNW|1|B|G|70BPh
7VNW|1|B|U|117VNW|1|B|A|24cWW
7VNW|1|B|U|117VNW|1|B|C|12s35
7VNW|1|B|U|117VNW|1|B|U|110BPh
7VNW|1|B|U|17|||a7VNW|1|A|G|185BPh
7VNW|1|B|U|17|||a7VNW|1|B|U|17|||a0BPh
7VNW|1|B|U|207VNW|1|B|U|20n0BP
7VNW|1|B|U|337VNW|1|B|A|35ntSH
7VNW|1|B|U|337VNW|1|B|C|36ntSH5BPh
7VNW|1|B|U|337VNW|1|B|U|330BPh
7VNW|1|B|U|507VNW|1|B|A|64cWW
7VNW|1|B|U|507VNW|1|B|G|51s35
7VNW|1|B|U|507VNW|1|B|G|65s55
7VNW|1|B|U|507VNW|1|B|U|500BPh
7VNW|1|B|U|547VNW|1|B|G|53s53
7VNW|1|B|U|547VNW|1|B|U|540BPh
7VNW|1|B|U|607VNW|1|B|G|195BPh
7VNW|1|B|U|607VNW|1|B|G|59s53
7VNW|1|B|U|607VNW|1|B|U|600BPh
7VNW|1|B|U|87VNW|1|B|A|14tWH
7VNW|1|B|U|87VNW|1|B|A|21tSS
7VNW|1|B|U|87VNW|1|B|U|80BPh


Base-PairsCount (39)Relative Frequency
cWW340.872
tWH20.051
cWS10.026
tHH10.026
tSS10.026
Base-PhosphateCount (116)Relative Frequency
5BPh60.052
6BPh20.017
8BPh20.017
0BPh1060.914
Base-StackingCount (56)Relative Frequency
s3340.071
s53240.429
s55280.500

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

ndbadmin@ndbserver.rutgers.edui ©1995-2022 The Nucleic Acid Database Project | Rutgers, The State University of New Jersey