## NDB ID: 6HKT PDB ID: 6HKT

### Title:

STRUCTURE OF AN H1-BOUND 6-NUCLEOSOME ARRAY

### Molecular Description:

Histone H3.1

Histone H4

Histone H2A type 1-B/E

Histone H2B type 1-J/DNA Complex

### Deposited:

2018-09-08

### Released:

2018-10-31

### Structural Keywords:

B DOUBLE HELIX

### Nucleic Acid Sequence:

Click to show/hide 2 nucleic acid sequences

Chain I

(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC) (DC)(DC)(

DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG) (DA)(DG)(DG)(DC)(D

C)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA) (DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT

)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)

(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(

DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(D

A)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA

)(DT)(DA)(DT)(DA) (DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)

(DA)(DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)

(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC) (DG)(DG)(

DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT) (DG)(DG)(DT)(DC)(D

G)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA

)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC) (DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)

(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC) (DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(

DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT) (DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(D

G)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG) (DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG

)(DC)(DA)(DT)(DG) (DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)

(DC)(DC) (DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)

(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG) (DC)(DT)(

DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC) (DT)(DC)(DT)(DA)(D

G)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC

)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG) (DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)

(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT) (DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(

DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(D

A)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT) (DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA

)(DG)(DC)(DC)(DC) (DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)

(DC)(DG) (DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)

(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT) (DA)(DG)(

DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT) (DA)(DA)(DA)(DC)(D

G)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC) (DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG

)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA) (DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)

(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC) (DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(

DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT) (DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(D

G)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA) (DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT

)(DA)(DT)(DA)(DC) (DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)

(DC)(DC) (DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)

(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC) (DA)(DC)(

DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG) (DC)(DG)(DC)(DT)(D

G)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA) (DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA

)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC) (DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)

(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA) (DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(

DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT) (DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(D

C)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC) (DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC

)(DC)(DT)(DG)(DG) (DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)

(DC)(DC) (DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)

(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(

Chain J

(DA)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA) (DC)(DA)(

DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(D

C)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG) (DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC

)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)

(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(

DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG) (DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(D

C)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG

)(DG)(DA)(DT)(DT) (DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)

(DT)(DA) (DG)(DG)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)

(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DT)(DC)(

DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC) (DT)(DA)(DG)(DG)(D

G)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA

)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)

(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG) (DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(

DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC) (DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(D

T)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC) (DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC

)(DG)(DG)(DC)(DC) (DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)

(DC)(DT) (DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)

(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC) (DT)(DG)(

DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC) (DC)(DC)(DT)(DT)(D

G)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG) (DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG

)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT) (DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)

(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT) (DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(

DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC) (DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(D

T)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG) (DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG

)(DG)(DT)(DC)(DT) (DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)

(DG)(DC) (DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)

(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA) (DG)(DT)(

DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(D

C)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT

)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)

(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(

DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(D

C)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT) (DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT

)(DT)(DC)(DA)(DA) (DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)

(DA)(DT) (DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)

(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG) (DC)(DG)(

DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA) (DG)(DC)(DG)(DC)(D

G)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC) (DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA

)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA) (DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)

(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA) (DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(

DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DC)(D

T)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC) (DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC

)(DA)(DG)(DG)(DA) (DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)

(DG)(DC) (DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)

(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(

### Protein Sequence:

Click to show/hide 4 protein sequences

Chain A,E,a,e,K,O,k,o,U,Y,u,y

GSHMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQ DFKTDLRFQ

SSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

Chain C,G,c,g,M,Q,m,q,W,0,w,2

GSHMSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKT RIIPRHLQL

AIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK

Chain B,F,b,f,L,P,l,p,V,Z,v,z

GSHMSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHA KRKTVTAMD

VVYALKRQGRTLYGFGG

Chain D,H,d,h,N,R,n,r,X,1,x,3

GSHMPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGE ASRLAHYNK

RSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

### Primary Citation:

Garcia-Saez, I., Menoni, H., Boopathi, R., Shukla, M.S., Soueidan, L., Noirclerc-Savoye, M., Le Roy, A., Skoufias, D.A., Bednar, J., Hamiche, A., Angelov, D., Petosa, C., Dimitrov, S.

Structure of an H1-Bound 6-Nucleosome Array Reveals an Untwisted Two-Start Chromatin Fiber Conformation.

*Mol. Cell*, **72**, pp. 902 - 915.e7, 2018.

### Experimental Information:

X-RAY DIFFRACTION

### Space Group:

P 2 21 21

### Cell Constants:

a = 111.078 b = 238.761 c = 674.368 (Ångstroms)

α = 90.0 β = 90.0 γ = 90.0 (degrees)

### Refinement:

The structure was refined using the PHENIX program.
The R value is 0.2554 for 11204 reflections in
the resolution range 49.074 to 9.7 Ångstroms
with Fobs > 0.31 sigma(Fobs) and with I > 0.0 sigma(I)