## NDB ID: PD0639 PDB ID: 1ZBB NAKB(beta): PD0639

### Title:

STRUCTURE OF THE 4_601_167 TETRANUCLEOSOME

### Molecular Description:

HISTONE/DNA Complex

### Deposited:

2005-04-08

### Released:

2005-07-12

### Structural Keywords:

B DOUBLE HELIX

### Nucleic Acid Sequence:

Click to show/hide 2 nucleic acid sequences

Chain I

(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA) (DA)(DC)(

DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA) (DG)(DT)(DG)(DT)(D

A)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA

)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT) (DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)

(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC) (DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(

DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA) (DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(D

T)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC) (DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA

)(DG)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)

(DC)(DA) (DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)

(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA) (DC)(DT)(

DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG) (DT)(DT)(DC)(DA)(D

G)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA) (DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC

)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA) (DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)

(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG) (DT)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(

DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT) (DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(D

C)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT) (DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)

Chain J

(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA) (DA)(DG)(

DT)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA) (DG)(DA)(DT)(DA)(D

C)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT) (DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC

)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA) (DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)

(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC) (DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(

DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT) (DG)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(D

A)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC) (DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC

)(DA)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DA)

(DG)(DT) (DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)

(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA) (DG)(DT)(

DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DT)(DC)(DA)(D

A)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT) (DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC

)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC) (DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)

(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA) (DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(

DG)(DG)(DT)(DA)(DG)(DT)(DA)(DT)(DC) (DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(D

C)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA) (DT)(DG)(DT)(DA)(DA)(DG)(DT)

### Protein Sequence:

Click to show/hide 4 protein sequences

Chain A,E,a,e

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAV

MALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

Chain C,G,c,g

SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRN

DEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK

Chain B,F,b,f

SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYA

LKRQGRTLYGFGG

Chain D,H,d,h

PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRL AHYNKRSTI

TSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

### Primary Citation:

Schalch, T., Duda, S., Sargent, D.F., Richmond, T.J.

X-ray structure of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre.

*Nature*, **436**, pp. 138 - 141, 2005.

### Experimental Information:

X-RAY DIFFRACTION

### Space Group:

I 2 2 2

### Cell Constants:

a = 127.675 b = 168.445 c = 237.126 (Ångstroms)

α = 90.0 β = 90.0 γ = 90.0 (degrees)

### Refinement:

The structure was refined using the REFMAC program.
The R value is 0.386 for 1992 reflections in
the resolution range 50.0 to 9.0 Ångstroms
with Fobs > 0.0 sigma(Fobs) and with I > 0.0 sigma(I)